哈尔滨工业大学生物医学工程一级学科博士授权点于2005年获批，是工信部重点学科、学科方向包括纳米生物技术、生物信息技术、航天医学工程、生物材料与组织工程和医疗仪器设备等。历经十五年发展，学科人才培养、科学研究和社会服务能力显著提升，2017年以生物医学工程学科为主体的“临床医学学科”进入ESI全球前1%。2022年5月11日，泰晤士高等教育（Times Higher Education, THE）发布了第三版中国学科评级，包括了91所中国大陆高校，涵盖82门学科，我校生物医学工程评级结果为A。